人骨髓来源内皮祖细胞分离自骨髓；骨髓是机体的造血组织，位于身体的许多骨骼内。骨髓来源内皮祖细胞主要存在于骨髓、脐血和外周血，但是少量的内皮祖细胞也被发现存在于脂肪组织、脾脏、心脏、血管、骨骼肌部位。在组织缺血部位，内皮祖细胞参与血管的新生。最近的证据表明心血管功能和血管发生受到起源于骨髓的循环的未成熟细胞的显著调节，增加血管发生，提高血管修复和改善内皮功能。外周血中所含内皮祖细胞极低，因此选用骨髓来分离内皮祖细胞。

人骨髓来源内皮祖细胞采用冲洗骨髓、密度梯度离心、差速贴壁法结合内皮细胞专用培养基培养筛选制备而来，细胞总量约为5×10⁵cells/瓶。