小鼠毛囊干细胞分离自毛囊组织；毛囊是表皮细胞连续形成的袋样上皮。研究发现，毛囊干细胞具有多向分化潜能，它可以分化成表皮、毛囊、皮脂腺，参与皮肤创伤愈合的过程。其毛囊干细胞和其它成体干细胞一样，具有慢周期性、未分化性、自我更新和体外增殖能力强等特点。毛囊干细胞分化经毛囊干细胞(hair follicle stem cells，FSC)、短暂增殖细胞(transit amplifying cells，TAC)有丝分裂后分化细胞(postmitotic differentiating cells，PDC)三个阶段。毛囊干细胞在光镜下呈立方形，细胞体积小，核浆比率大，表面光滑，皱褶少，又被称为非锯齿形细胞，细胞体积的增大与增殖能力呈负相关。超微结构显示细胞表面有少许微绒毛，细胞核存在许多卷曲，染色质弥散分布，这些形态特征均表现出原始细胞的特性。

小鼠毛囊干细胞采用胶原酶 - 中性蛋白酶联合消化制备而来，细胞总量约为5×10⁵cells/瓶。